Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rimbp3Q3V0F0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rimbp3Q3V0F0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms