Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd3l2Q3UXB0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms