Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms