Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc114Q3UX62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc114Q3UX62 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms