Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
E330034G19RikQ3UWX6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms