Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr1d1Q3UV55 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr1d1Q3UV55 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms