Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skap1Q3UUV5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skap1Q3UUV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms