Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28047Q3US59 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm28047Q3US59 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms