Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd27Q3UMR0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd27Q3UMR0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms