Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LbrQ3U9G9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LbrQ3U9G9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms