Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hectd3Q3U487 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms