Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TTJ4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q3TTJ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms