Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc102aQ3TMW1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms