Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdlim7Q3TJD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdlim7Q3TJD7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdlim7Q3TJD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms