Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chrna5Q2MKA5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chrna5Q2MKA5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms