Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrp1aQ2LKU9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp1aQ2LKU9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp1aQ2LKU9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms