Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cpne9Q1RLL3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cpne9Q1RLL3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms