Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Spatc1Q148B6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Spatc1Q148B6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Spatc1Q148B6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Spatc1Q148B6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Spatc1Q148B6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spatc1Q148B6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms