Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gli2Q0VGT2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli2Q0VGT2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms