Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntnap5cQ0V8T7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntnap5cQ0V8T7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5cQ0V8T7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms