Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TrioQ0KL02 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms