Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700061G19RikQ08EE8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700061G19RikQ08EE8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms