Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MestQ07646 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MestQ07646 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MestQ07646 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MestQ07646 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MestQ07646 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MestQ07646 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MestQ07646 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MestQ07646 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MestQ07646 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MestQ07646 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms