Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emx2Q04744 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms