Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nf1Q04690 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms