Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cxcr5Q04683 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cxcr5Q04683 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms