Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnb1Q03717 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms