Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tff2Q03404 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tff2Q03404 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff2Q03404 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms