Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Thbs2Q03350 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms