Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nme2Q01768 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nme2Q01768 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms