Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pitx2P97474 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms