Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas1P97459 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas1P97459 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms