Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nbr1P97432 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nbr1P97432 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms