Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptlc2P97363 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sptlc2P97363 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptlc2P97363 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptlc2P97363 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms