Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkp1P97350 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp1P97350 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms