Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp2P97299 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp2P97299 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sfrp2P97299 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sfrp2P97299 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms