Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx3P81067 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx3P81067 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms