Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp9xP70398 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9xP70398 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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