Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfi1P70338 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfi1P70338 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms