Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cplx1P63040 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cplx1P63040 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cplx1P63040 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cplx1P63040 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cplx1P63040 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cplx1P63040 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cplx1P63040 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms