Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps27aP62983 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps27aP62983 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms