Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hpcal1P62748 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hpcal1P62748 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms