Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Acta2P62737 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Acta2P62737 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms