Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab11aP62492 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab11aP62492 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms