Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps13P62301 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps13P62301 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps13P62301 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps13P62301 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps13P62301 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rps13P62301 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps13P62301 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps13P62301 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps13P62301 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps13P62301 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms