Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps11P62281 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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