Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Depdc5P61460 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Depdc5P61460 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Depdc5P61460 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms