Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2d1P61080 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2d1P61080 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2d1P61080 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ube2d1P61080 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2d1P61080 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2d1P61080 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d1P61080 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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