Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Romo1P60603 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Romo1P60603 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms