Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps5P59438 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hps5P59438 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hps5P59438 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms