Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Senp1P59110 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Senp1P59110 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Senp1P59110 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Senp1P59110 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms